Бетадин® несовместим с другими антисептическими средствами, особенно содержащими щелочи, ферменты и ртуть. В присутствии крови бактерицидное действие может уменьшаться, однако при увеличении концентрации раствора бактерицидная активность может быть увеличена.
При взаимодействии с некоторыми органическими веществами (танин, сахар, уголь, спирт, глицерин, органические кислоты) или легкоокисляющимися веществами (сера, натрия тиосульфат, натрия нитрат, железо восстановленное) может произойти взрыв. При взаимодействии с бромидами, йодидами, хлоридами выделяются свободные галоиды.